CD er en kronisk sykdom. De fleste kan allikevel leve et bra liv ved hjelp av legemiddelbehandling. Hensikten med behandlingen er å hindre aktiv sykdom og forebygge oppblussing. Hvilke legemidler du får avhenger dels av sykdommens alvorlighetsgrad og dels av hvor i tarmen betennelsen sitter samt hvor utbredt den er. Du trenger trolig å ta en eller annen form for legemiddel i lengre perioder. Derfor er det viktig at du sammen med din lege finner en behandling som passer nettopp deg. Du kan velge mellom ulike legemiddelformer som f.eks. tabletter, kapsler, dosegranulat (pose med små korn) eller injeksjoner.
Flere ulike betennelsesdempende legemidler brukes for behandling av CD: Steroider, aminosalisylsyrepreparater
(5-ASA), immunhemmende midler og biologiske legemidler (TNFa-hemmer). I tillegg brukes også antibiotika.